PART 1 固有方法下新增小粒径规格色谱柱
SUMMER
Evosep One原来固有的5种色谱方法(划重点,Evosep One每个梯度方法系统都是自己设定好的,选择对应的方法即可,快速简便),在每个方法下有各自推荐的色谱柱规格类型,可以看到之前建议使用的都是基于3μm粒径的色谱柱规格。
随着Evosep One的升级,在ASMS会议上Evosep新出了基于每种色谱方法下新推荐的色谱柱规格(如下图),其中最大的变化是新增了粒径更小的1.5μm或者1.9μm的色谱柱。
那么在这些新出的色谱柱下,我们的数据能达到什么结果呢?
样本:Hela细胞,500ng配置:Evosep+Orbitrap Exploris 480Evosep One方法:如下表,室温条件质谱方法:如下表,DDA采集
结果:
(1)如下图,较之以往的3μm色谱柱上的结果,在新推出的色谱柱条件下的鉴定数均较以往增加。如在DDA采集模式下,30 samples/day的方法能够达到蛋白鉴定数3935,较之以往的鉴定数增加38%。
(2)将鉴定数/每个方法有效梯度时间,得到单位时间内的蛋白鉴定数。由此,我们可以推测,当我们选择以下方法中通量较高的方法时(如200 samples/day),一些多维分级策略处理的样本会比较合适。当想对通量和深度做一个折中时,类似60 samples/day的方法会比较合适。
PART2 推出Performance Column
让我们回到这张图,我们可以看到在100 samples/day和60 samples/day方法下,新出的这根色谱柱有一个别称叫做“High Performance”。
结果:(1)在100 samples/day和60 samples/day方法下,BSA样本,提取峰722,分别使用Standard Column和Performance Column,Performance Column下色谱峰峰宽变窄,峰容量增加。
(2)将Evosep One搭配Orbitrap Exploris 480 MS,分别在60 samples/day和100 samples/day的方法下进样不同上样量的Hela样本,使用Performance Column和Standard Column达到的蛋白鉴定数对比。可以从下图中看到,在上样量5ng的条件下,使用Performance Column较之以往增加的蛋白鉴定数最多。
PART 3 Evosep +
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Evosep还发布了Evosep +扩展方法,即在原先的5种标准方法下,新发布了15 samples/day的方法,一针92 min,包括其中的88 min有效梯度和4 min的Overhead time,该方法下的色谱柱规格是15 cm, 150μM*1.9μM。该方法的研发是为了满足更高深度的需求。
很多客户常常会有个疑问,Evosep One的通量大是基于什么原理实现的,大家可以看下面的图,AS(自动进样器)、ABCD4个低压泵和HP高压泵在很多环节的时候都是同时运行功能的,这样就大幅度节省了时间。
接下来看一下在该方法下的结果。
结果:(1)如下图,分别在3台Evosep One机器上测试,选取15 samples/day的方法,提取BSA样本的5个离子峰,峰形优异且保留时间稳定。
(2)分别在2个不同的实验室测试Evosep One,每个实验室分别用其自己专有的方法来处理Hela样本。从下图中可以看到,在15 samples/day的方法下,500 ng的Hela上样量在Site 1和Site 2得到的蛋白鉴定数差不多,几乎能达到5000。而在上样量较小的情况下如5ng,结果稍有点差异,可能是由于每个实验室前处理不同引起。
总结,Evosep在新色谱柱和新功能扩展下得到的数据较之以往进一步优化,能给客户带来更好的仪器性能和数据质量上的体验。
2022-05-05
2022-04-14
2022-04-12
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