揭示突变后黑色素瘤细胞中多条耐药途径
耐药性会使癌症治疗策略复杂化。虽然一些研究试图通过基因表达来阐明实体瘤治疗过程中的耐药性机制,但这类数据并不能真正描绘出单细胞水平抗药性的蛋白质组路径。IsoPlexis 的单细胞胞内蛋白解决方案提供了缺失的数据层,助力于有效的组合疗法的开发。此方法通过检测多达 15+ 种胞内蛋白的多重分析方法描绘出肿瘤细胞内部的完整网络通路,远远超出了一次只能分析少量分析物的传统方法。
在《Nature Communications》上发表的一项研究"单细胞多组学分析揭示了黑色素瘤细胞中影响药物耐受性的多个独立通路"中,Su等人使用了一种特征明确的黑色素瘤细胞系,已知该系细胞可以迅速发展耐药性,并采用多种分析方法来揭示单个细胞中功能表型如何随着时间的变化而变化。利用IsoPlexis的单细胞胞内蛋白组学及代谢组学分析技术,定义肿瘤细胞在耐药性发展过程中采用的多条独立路径。
在这项研究中,研究人员用BRAF抑制剂(BRAFi)连续治疗五天突变黑色素瘤癌细胞(BRAFV600E M397),每天都用IsoPlexis技术进行分析。通过对肿瘤细胞的表型标记、胞内信号、细胞增殖和代谢活性的的多组学检测,而这些标记和信号在初步药物反应中都发生了变化。第1天,大多数代谢调节因子和磷蛋白信号被阻断,表明BRAFi治疗工作正常。然而,在第3天,许多标记显示方差急剧上升或暂时上升,表明此时多个细胞的状态发生改变。到第5天,大多数细胞已经进入衰老状态,一些细胞还呈现出间充质表型特征。
通过更加全面的分析肿瘤细胞信号通路创建临床前意义
错综复杂的耐药途径使针对耐药性机制的研究更加困难。然而,在此项研究中作者发现了两种非常敏感且相互独立的耐药途径。利用IsoPlexis 平台正确预测了通过同时抑制这两种途径来有效对抗肿瘤细胞耐药性的组合疗法。这些数据现在可以帮助研究人员用于开发联合免疫疗法,以防止出现这种常见的耐药细胞状态。
IsoPlexis 的胞内信号通路解决方案只需1-2天就可以得到传统方法可能需要数周或数月的时间才能分析的两种路径之间相互作用的结果,不仅为您节省了宝贵的时间同时分析多条路径相互作用,而且无需生物信息学专家,IsoSpeak就可以提供更加智能且高效的数据分析。IsoPlexis 的胞内信号通路解决方案具有独特的临床前意义,具有高通量,可识别传统方法遗漏的耐药性目标等优势。
参考文献:
1. Su, Y. et al. Multi-omic single-cell snapshots reveal multiple independent trajectories to drug tolerance in a melanoma cell line. Nat. Commun. 1–12 (2020)
2022-05-05
2022-04-14
2022-04-12
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