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Evosep One助力新冠肺炎高通量研究
来源:大分子生物 | 作者:Neoline | 发布时间: 2021-05-19 | 1441 次浏览 | 分享到:
Evosep One助力新冠肺炎高通量研究。截至目前,全球有超过500万人对β冠状病毒SARS-CoV-2进行了检测。该病毒感染会引起COVID-19疾病的发展,其表现为多种症状,包括持续的干咳,气短,发冷,肌肉疼痛,头痛,味觉减退或气味和胃肠道不适。Evosep One高通量蛋白组学分离系统,近期也开始活跃于最新新冠肺炎的蛋白组学的应用场景中。

  截至目前,全球有超过500万人对β冠状病毒SARS-CoV-2进行了检测。该病毒感染会引起COVID-19疾病的发展,其表现为多种症状,包括持续的干咳,气短,发冷,肌肉疼痛,头痛,味觉减退或气味和胃肠道不适。

  Evosep One高通量蛋白组学分离系统,近期也开始活跃于最新新冠肺炎的蛋白组学的应用场景中。以下两篇文献分别报道了Evosep One参与检测细胞因子IL-6、病毒感染后DIA蛋白质组和DIA磷酸化蛋白质组的独特优势。

  Evosep One在COVID-19中的首次血清蛋白质组应用


  尽管促炎性细胞因子如白细胞介素IL-6的水平高低与COVID-19疾病的严重程度有关,但目前关于IL-6因子水平对COVID-19患者蛋白质组的影响知之甚少。

  因此,美国科罗拉多大学、哥伦比亚大学和弗吉尼亚大学的研究者们对COVID-19患者的血清进行了首次蛋白质组学分析。研究者对33名COVID-19病人(鼻咽拭子核酸检测为阳性)和16名未患COVID-19病人(鼻咽拭子核酸检测2次均为阴性)分别取200 ng血清样本,将Evosep One搭载timsTOF Pro进行血清蛋白质组学研究。

  研究表明,COVID-19的患者显示IL-6水平明显上调,IL-6因子是COVID-19的生物标志物。研究按照循环IL-6的水平对疾病进行轻重程度的分层,并且发现一些凝血因子在血清中的水平明显失调与IL-6有关,且伴随着包括几种丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPINs)的抗纤溶成分水平的升高。


  Evosep One在SARS-CoV-2研究中的DIA蛋白质组应用


  德国马普所生物化学研究所和慕尼黑工业大学的Matthias Mann和Andreas Pichlmair研究团队研究了紧密相关的SARS-CoV-2和SARS-CoV两种病毒,以及SARS-CoV-2病毒对肺源性人类细胞系的转录组、蛋白质组、泛素组和磷酸化蛋白质组等多组学方面的影响。

  研究者将高通量的Evosep One与Q Exactive HF-X相连,对被病毒感染后的细胞样本进行蛋白组学分析。实验分别采用44 min/样本的方法分析DIA蛋白质组,21 min/样本的方法分析磷酸化蛋白质组。

  本研究的意义在于,通过对SARS-CoV-2的多组学研究,可以用于指导新冠肺炎的药物筛选。研究最后根据其得到的多组学结果测试了48种药物,这些药物可调节病毒干扰路径对SARS-CoV-2复制的影响。其中,B-RAF、JAK1/2、MAPK抑制剂在体外感染环境中能导致病毒生长显著增加,而DNA损伤诱导剂、mTOR抑制剂会导致病毒被抑制。在药物筛选中Gilteritinib、Ipatasertib、Prinomastat、Marimastat这4种药物抗病毒作用最显著。


  不论是血液样本还是组织样本,Evosep One在新冠肺炎中的强力优势点在于,能够帮助高通量样本的检测实现,以及稳健的性能体验。

  参考文献:

  [1] Angelo D’Alessandro, et al. Serum proteomicsin COVID-19 patients: Altered coagulation and complement status as a functionof IL-6 level, medRxiv (2020).

  [2] Alexey Stukalov, et al. Multi-levelproteomics reveals host-perturbation strategies of SARS-CoV-2 and SARS-CoV,bioRxiv (2020).


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