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Evosep线上会议预告——通过使用Evosep, 释放DIA技术与短梯度结合的力量
来源:大分子生物 | 作者:Neoline | 发布时间: 2021-05-27 | 1858 次浏览 | 分享到:
会议时间:2021年5月27日晚10点-11点
会议主题:A PRACTICAL GUIDE TO HIGH-THROUGHPUT DATA-INDEPENDENT ACQUISITION

  在现在的蛋白质组学研究热潮中,很明显,Evosep One的短梯度高通量与质谱的DIA技术已成为一种成功的组合。

  在本次Evosep举办的网络研讨会期间,弗洛里安·迈耶(Florian Meier, Friedrich Shiller University,Jena)和瓦迪姆·德米切夫(Vadim Demichev,克里克学院和剑桥大学)将讨论Evosep One如何与DIA技术碰撞出火花。

  杭州纽蓝诚邀您参加此次Evosep One会议观看。

  会议时间:2021年5月27日晚10点-11点

  讲者及主题介绍:

  主题:A PRACTICAL GUIDE TO HIGH-THROUGHPUT DATA-INDEPENDENT ACQUISITION

  讲者:Florian Meier

  内容:对于基于高通量质谱的蛋白质组学而言,DIA技术是一种越来越有吸引力的策略。 本演讲将介绍最新的采集方法,例如非常快速的Orbitrap质量分析和diaPASEF。 研究者突出显示了关键的方法参数,并说明了它们对短梯度的优化。 同时,研究者将讨论离子迁移质谱仪如何将其自身的特性如提高离子采样效率,提高灵敏度并降低光谱复杂度的优势与Evosep结合起来,,从而实现每天跑60个样品的高通量水准,对6,000种蛋白质进行准确的无标记定量。

  Data-independent acquisition (DIA) is an increasingly attractive strategy for high-throughput mass spectrometry-based proteomics. This presentation will give an introduction to state-of-the-art acquisition methods such as very fast Orbitrap mass analysis and diaPASEF.

  We highlight key method parameters and illustrate their optimization for short gradients. Finally, we will discuss the integration of ion mobility spectrometry to improve ion sampling efficiency, increase sensitivity and reduce spectral complexity, leading to accurate label-free quantification of 6,000 proteins at a throughput of 60 samples per day.

  主题:BEYOND 5000 PROTEINS IN 4.8 MINUTES FROM LOW SAMPLE AMOUNTS

  讲者:Vadim Demichev

  内容:在针对蛋白质组学的研究中,对高通量的需求越来越迫切。在之前几场的讲座中,已经介绍了DIA-NN,这是一个基于神经网络的软件套件,能够在60秒的时间内获取复杂DIA蛋白质组的数据。 现在,研究者展示了DIA-NN可以应用到timsTOF Pro和Evosep One上,以对200ng的Hela样本为例,采取200样本/天的检测方法,定量分析得到5000多种蛋白质。该工作流程可以实现高通量蛋白质组学,其数据质量和样品量要求可与长梯度nanoLC方法相媲美。

  There is an increasing need for fast methods in proteomics. We have previously introduced DIA-NN, a neural network-based software suite capable of processing complex DIA proteomic data acquired with gradients as fast as 60-seconds. We now show that DIA-NN quantifies over 5000 proteins from just 200ng of a HeLa sample analysed with the 200 samples/day method on an Evosep One coupled to a timsTOF Pro.

  This workflow enables high-throughput proteomics with data quality and sample amount requirements comparable to long-gradient nanoLC methods.

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